Child tema kullanabilirsiniz. functions.php ve style.css özelleştirmeler için fazlasıyla yeterlidir. Ayrıca child tema aktifken, orjinal temanın editlemek istediğiniz dosyalarını child temaya yükleyip editlediğiniz zaman o dosyanın orjinalinin üzerine yazmaktadır. Bunu tavsiye etmem çünkü güncellemeden sonra o dosyada temel değişiklikler olursa sizde aynısını child temaya uygulamak zorunda kalırsınız aksi halde sitede sorunlar oluşması kaçınılmaz olur.
Veya deregister ile istekleri kendinize göre değiştirip kaydedebilirsiniz. Ama hertürlü kısıtlı olur.
Zaten kaliteli, gelişmiş diyeceğimiz temaların bir özelliği de budur. Gereksiz sorguları çekmek yerine sadece gerekli olanları alırlar. Bahsettiğiniz kadar çok edit yapılması gerekiyorsa zaten temayı değiştirmek en iyisi olur.