Hocam bu şekilde de olmuyor ki. Tüm permalinkleri ayarlıyor bu. Dediğimi tam anlamadınız galiba.

Sadece tek bir kategorinin altındaki yazılar
siteismi.com/o-kategori/yazı-ismi
şeklinde gözükmesi lazım.
O kategorinin haricindeki kategorilere ait olan yazılar ise
siteismi.com/yazı-ismi
şeklinde görünmeli