Her kategori için alt dizinlere ayrı ayrı wordpress kurmuşsunuz anladığım kadarıyla. Niçin böyle bir yönteme başvurdunuz anlam veremedim. Bu yöntem çok verimsiz olur. Hem disk alanı, hem cpu sorunları ortaya çıkacaktır.
Mutlaka ortak veritabanı kullanmanın yolu vardır, uzman arkadaşlar daha iyi bilirler fakat bu sistemin verimli olacağını hiç sanmıyorum.