comments tablosunda parent_id adında bir sütun olsun. Yoruma cevap verirken yorumun id'sini de gönderip parent_id'ye kaydet. Listelerken önce parent_id 0 (parent'i 0 olanlar üst yorumdur) olanları listele sonra bir foreach ile her item'ın id'sini parent_id'lerde ara ve cevap olarak listele. Bu noktada nested child-parent yorumlar söz konusu ise recursive konusunu araştırmalısın.