Olayı şu şekilde çözdüm.
Normal woocommerce kurulumu yaptıktan sonra Woocommerce > Siparişler > Sipariş Ekle 'den hizmet tanımlayacağımız müşterinin adını girip seçiyoruz ve aşağıdan ücret ekle diyerek veya Woocommerce > Ürünler'den özel ürün ekleyip buradan seçerek hesabına tanımlıyoruz. Tanımladığımız ücreti veya ürünü müşteri kendi panelinden siparişlerim sayfasından görüyor ve ödemesini hangi entegrasyonlar mevcutsa onlardan yapabiliyor veya biz ona tanımlarken ödeme aracını seçebiliyoruz sadece onunla yapıyor. Gene Woocommerce > Siparişler'den müşterinin siparişine notlar ekleyebilir, durumunu işleniyor, ödeme bekleniyor gibi güncelleyebilirsiniz. İnşallah birilerine katkım olur. Kolay gelsin.

Ek olarak: Destek bileti gönderme işlemlerini de özel wordpress-woocommerce eklentileri ile yapabilirsiniz. Themeforestta bir kaç eklenti mevcut fakat pek sinmedi içime.