WordPress'de biraz zor dediğiniz filtreleme eklentileri bir yere kadar iş görüyor ancak sizin söylediğiniz daha kapsamlı bir şey yani temel mantık:

A) Hazır ürün şablonları olacak tüm özellikleri dahil edilmiş.
B) Ürünün en saf ve özelliksiz şablonu olacak ve kullanıcı ekstra özellikleri, seçimleri bu şablona dahil edecek, dahil ettikçe de fiyat vb. kısımlar değişecek.

Bu mantığı uygulamak için "Wordpress product customizer" gibi eklentileri araştırabilirsiniz yani ürün özelleştirici eklentiler. En azından bir yere kadar işinizi görebilir.