hım ozaman hocam şöyle yapalım şimdi ben sana kaba taslak söylüyorum ama bu temaya göre değişebilir

wp-content/themes/kullandığınız-tema/css/layout.css notepad ile açın

Header aratın orada logo boyut yeri vardır oradan kendi logonuza göre büyüklüğü ayarlayın
mesela örnek benim ayarım bu : width: 360px; height: 99px; margin: 0; padding: 0;