Hocam siteme de yükledim gördüğün gibi sorunsuz çalışıyor. Sizde nasıl bir problem var anlamış değilim. Şuanki sürüme localde mi kuruyorsunuz yoksa siteniz üzerinde mi? Eğer localde de yeni sürümde sorun çıkıyorsa birşey diyemem ama localde yeni sürümde düzgün görünüp sitenizde yeni sürümde bozuk gösteriyorsa başka bir CHMOD ayarından kaynaklanabilir.

Ek Olarak: Sorunu buldum hocam. Nette biri paylaşmış. Temanın içindeki includes/theme-options.php dosyasını açıyorsun. Beşinci satırda şunu göreceksin.

$settings = 'mods_'.get_current_theme();

Bunu şununla değiştiriyorsun.

$settings = 'theme_mods_'.get_current_theme();

Ve olay çözülüyor. :)