Problemin neden ortaya çıktığını buldum beyler. :D En azından kendi sitem için hallettim diyebilirim.

Sorun GZippy eklentisinden kaynaklanıyor. Eklenti veya wordpress güncellerken GZippy eklentisini pasif hale getirip sorunsuzca güncelleyebilirsiniz.

Kaynak: http://soulmy.net/wordpress-veya-eklenti-guncelleme-sorunu-ve-cozumu/