WinSCP öneriyorum.
harika bir program
http://winscp.net/download/winscp510setup.exe
birde putty tavsiye ediyorum. putty, servere baglanmak icin bir terminal programidir.
servere sanki basindaymissiniz gibi baglanip istediginizi yapiyorsunuz.
putty'i ekseriyetle linux serverinde kullaniyorum.
http://the.earth.li/~sgtatham/putty/latest/x86/putty.exe