.htaccess dosyasını değiştirdiğinizde chmod ayarlarını 555 yapın birde öyle bakın değişecek mi değişmeyecek mi. Eğer değişmez ise mutlaka kullandığınız bir script veya eklenti htaccess dosyasını siliyordur(ki bu chmod ayarları silmesine veya üzerine yazılmasına izin vermez). Eğer ki yine siliniyor ise mutlaka FTP erişimi sağlıyor birisi ve siliyor.( Büyük ihtimal eklenti veya script siliyordur. error_log kayıtlarındada görebilirsiniz.)
şimdi error_log a baktım
[15-Nov-2012 00:42:48 UTC] PHP Warning: mysql_connect() [function.mysql-connect]: Too many connections in /...public_html/wp-content/plugins/wordfence/lib/wfDB.php on line 56
uyarısı bol miktarda var.bunun bir anlamı olabilir mi?zaten wordfence eklentisi ile scan yapmaya çalıştığımda da scan error vererek duruyor.