Sorun olmaz. Yaptığın ayarlar senin daha önce oluşturduğun Mysql dosyasına işleniyor. Sen sadece güncel dosyaları değişiyorsun yeni ayarlar otomatikmen yazılıyor sadece eski hatalı dosyayı değişmiş ve varsa açık veya gelişme onları sağlamış oluyorsun.