function externalLinks() {
if (!document.getElementsByTagName) return;
var anchors = document.getElementsByTagName("a");
for (var i=0; ivar anchor = anchors[i];
if (anchor.getAttribute("href") &&
anchor.getAttribute("rel") == "external")
anchor.target = "_blank";
}
}
window.externalLinks;

Bunu external.js diye kaydet ve temanın ana dizinine yükle. Sonra header.php içinde head tagından önce şu kodları koy:

<script>/external.js">
</script>

Ek Olarak: Eğer temanın dışındaki dosyalara müdahale edersen ilk güncellemede yaptığın değişiklikler eski haline geri döner.

kaynak : http://www.samet.web.tr/external-linkleri-yeni-pencerede-acmak.html