Merhaba,

js, css için compressor siteleri var. Bu şekilde sıkıştırabilirsiniz birde js kullanırken 2 farklı yönetimi vardır jquery-1.8.1.min.js vardır birde jquery-1.8.1.js vardır min.js sıkıştırılmış halidir.

İşlemlerinizi yapmadan önce yedek almanızı tavsiye ederim.