rel="prettyPhoto[2]" w3c 'ye göre tanımlı bir şey değil.
rel="prettyPhoto[2]" kısmını sildiğinizde w3c doğrumalasından geçecektir.

Yalnız, bunu silerseniz, prettyphoto jquery özelliği çalışmaz.
Böyle rel="" den dolayı oluşan w3c hataları önemsiz hatalardır.

Bir de w3c hatasının tamamını yazarsanız daha doğru cevap da verebiliriz.