Sayfanızda virüs taraması yapmadıysanız bir bakın:
https://www.virustotal.com/tr/#url
Ayrıca hostunuzla görüşerek CPU kullanımı artıran işlemlerin neler olduğu hakkında bilgi edinebilirsiniz. (Hangi dosya, veritabanı kaynaklıysa hangi SQL komudu, vb.)