Bu aralar ben de blogengine.net ile uğraşıyorum ben de tema yükleme ile ilgili sorun yaşadım. Panelden customize sayfasından wordpress gibi otomatik tema yükleme olayı var bir kaç tane tema denemek istemiştim ancak hata oluşuyor. Temaları indirip ftp aracılığı ile de themes klasörüne atabilirsin ama ben o yöntemde de sorunla karşılaştım.
Ya temalar son sürüm ile uyumlu değil ya da yazma izinleri ile alakalıdır diye düşünüyorum.