Dün aynı işlemi ben de yaptım, ilk önce ns1.siteadresi.com için bir ip tanımlamanız gerekiyor, bi kaç saat beklemenizin sonrasında da dns ayarlarını hazırlamış olduğunuz ns'lere göre değiştirmelisiniz. VPS sanırım sizin site adınıza göre düzenlenmiştir zaten?