function yakuphoca_jwplayer_ekle($post_id='') {
global $post;
if (!$post_id) $post_id = $post->ID;
$youtube = get_post_meta($post_id,'youtube', true);
if ($youtube!="") { ?>
<script></script>

Sanırım kodda sorun var :D

<script>
jwplayer('mediaspace').setup({
'flashplayer': 'http://mehmetcabar.com/dosyalar/videoplayer/player.swf',
'file': '',
'controlbar': 'bottom',
'width': '580',
'height': '300'
});
</script>
}
?>

olarak oluşturabilirsiniz. çağırırken de yakuphoca_jwplayer_ekle($post->ID); şeklinde çağırabilirsiniz, eğer döngü içerisinde kullanıyorsanız sadece yakuphoca_jwplayer_ekle(); şeklinde çağırmanız yeterli.