Tamamen flash yaparsan sorun yok. İframe dediğimiz kodda tüm sayfalar iframe kodu içerisinde çalışmaktadır. Örneğin sayfamız index.php ise bu sayfamıza
kodunu ekliyoruz. site.php dosyası bir nevi sitenin ana sayfasıdır. Amacımız bu sayfaları index.php üzerinden çalıştırmış gibi yapmak. Bu yöntemle linkler adres çubuğunda da görünmeyecektir. İster iletisim.php tıklayın ister site.php adres çubuğundaki adres .../index.php olarak kalacaktır. Detay muhakkak forumda vardır. Kısa kısa anlattım. Elinizde mevcut kodlar varsa yardımcı olabilirim.

Kesinlikle popup pencere v.s. önermiyorum.