Ne demek istediğinizi ben de anlayamadım ama kodlara bakınca şurada kesin bir hata var. :)

RewriteRule ^([0-9a-zA-Z-/]+)$ $1.htm
RewriteRule ^([0-9a-zA-Z-/]+)$ $1.php

Buradaki 2 sorguda da ^([0-9a-zA-Z-/]+)$ yazıyor. Sanırım sizin hata da buradan kaynaklanıyor.