Filezillayı açın ve Düzenle sekmesinden Ayarları seçin
Açılan pencerede sol tarafta Dosya Düzenlemeye tıklayın
Sağ tarafta "Şu özel düzenleyiciyi kullan" seçeneğini seçin ve gözat kısmından notepad++ uygulamasını gösterin
"C:\Program Files\Notepad++\notepad++.exe" (Benim PC'de bu şekilde, sizde de böyledir büyük ihtimal.)
Son olarak tamam diyerek pencereyi kapatın.
Bundan sonra düzenleme yapmak istediğiniz dosyaya sağ tıklayıp göster/düzenle deyince notepad++ ile açılacak.