Php execution time ile alakalı bir durum kanımca.

http://www.php.net/manual/en/function.set-time-limit.php

The default limit is 30 seconds or, if it exists, the max_execution_time value defined in the php.ini.


Default değeri 30 saniye imiş. Dosya işlemlerinde çok küçükde bir değer olsa zaman aldığından execution timeout a düşüyordur. 10 saniyeye çekip denermisin.