forum sistemlerini bilmiyorum ama genel mantık şudur.
veritabanında linkler nasıl görünüyor kontrol etmelisin. burada iki parametre var.

/kategori/konu/54959.html
http://site.com/forum/kategori/konu/54959.html

yani linklerde site adresin domain ile başlamıyorsa sorun yok. klasörü değiştirmen yeterli olacaktır.

ama site adresi ile başlıyorsa o zaman veritabanını indirip notped++ ile [bul&değiştir] komutunu kullanarak

bul : http://site.com/forum/kategori/konu/54959.html
değiştir : http://site.com/kategori/konu/54959.html


bu işlemi yapmalısın.