Yapabilirsiniz.

1. Öncelikle iframe'e id verin

<script>
function test() {
var myIFrame = document.getElementById("iframe_id_niz");
var links = myIFrame.contentWindow.document.getElementsByTagName("a");
for (var index = 0; index < links.length; index++) {
links[index].removeAttribute('href');
}
}
</script>

2. ile JS'yi çağırabilirsiniz.

iyi çalışmalar...

Edit : Aklıma gelmişken bir diğer yöntem de şu olabilir. Oluşturduğunuz iframe'i bir div içerisine yerleştirip, daha sonra bu div'e z-index vererek arka planını da boş bir imaj dosyası yaparak hem seçimi hem de linklere tıklamayı engelleyebilirsiniz. Ama z-index ie6'da problem yaratıyor bilginiz olsun.