Böyle olmayacak mı hocam ?

Ya da en basitinden şuradakini uygulayabilirsiniz. Bu şekilde yaparsanız daha iyi olur çünkü sizin menü header'ın altında kalıyor.

http://www.sutanaryan.com/how-to-create-fixed-menu-when-scrolling-page-with-css-and-jquery/