Hangi hosting firmasını kullanıyorsunuz? Yani böyle bir sorun olmaması lazım. Size dosyalarınız kaybolacak gibisinden yorum yapmaları biraz tuhafa kaçıyor. Siz bence sisteminizdeki dosyaları hiç değiştirmeden direk olarak firmayla iletişim kurabilirdiniz, destek için. Hatayla ilgili hiç bir fikrim yok fakat böyle durumlarda. Veritabınınızı ve dosyalarınızı yedek aldıktan sonra yükleyip sadece wp-config.php'deki gerekli bilgileri doldurduğunuzda sitenizin açılması gerekiyor. Veritabanını hatasız bir şekilde yüklediğinizden emin misiniz?