Sunucu size mi ait? Başka dizinlerede upload etmişlerdir eğer duvarları aştılarsa, ve tekrar sitenize ulaşabilirler. Eğer değilse hosting sağlayıcınıza durumu bildirin dosya ve kod taraması yapsınlar.
Sunucu bana ait değil hocam(Godaddy) Dizinleri inceledim o dosya başka yerde yok. Artık kök dizinin de ötesine geçtilerse Godaddy ilgilensin:) İlgilendiğin için teşekkürler hocam.