Sanırım ben olsam şöyle yapardım. Yöneticilere level (seviye) verirdim. Silinmesini istemediğiniz yöneticilerin leveli 100 olsun. diğerleri 1 olsun. Sorguyu çekerken level!=100 derseniz gözükmez bile :)
Ama siz görünsünd e silinmesin isterseniz normal bir şekilde çeker if ($Level=100) {sil'i gizle } else { sil aktif et. }

şeklinde bir mantık kurabilirsiniz.
Diğer seçenek yöneticileri inputlarla (checkbox) dizer. En alta bir sil butonu koyarsınız seçili inputları bir diziye atar. Sil'e basıldığında dizideki id'leri silersiniz sistemde kasmamış olur.