İnternet dünyasında kodladığınız script patenti diye birşey yoktur. LiSANSLAMA ve Telif hakkı diye bir şey vardır.
Yapmanız gereken scriptinizi lisanslamak yani kriptolamak ve kodladığınız bu scriptin izinsiz olarak çoğaltılmasını engellemek. Buna bağlı olarak sattıklarınızın dışında kimse kullanamayacak. Bir şekilde lisansı kırıp kullansalar dahi, Warez olarak kullanılan sitenin hosting sağlayıcısına ulaşacak ve kaldırılmasını talep edeceksiniz.
Nasıl lisanslanır? konusuna gelecek olursak; ionCube PHP Encoder'ı araştırmanızı tavsiye ederim.
İyi çalışmalar.