Mfa Mail trafiği sizin site kaynaklarınızı etkilemiyor yani sayılmıyor diye biliyorum. Tabi emin değilim hosting firmanıza sorarsanız daha iyi olur bunu.
E-posta bülteni için Mailgun gibi bizzat o iş için uygun hizmetler kullanmak gerekir. Yandex limitleri bu iş için uygun değil. Kendileri de zaten e-mail marketing amacıyla piyasaya çıkmadılar. Sitenin iletişim formu için vs. kullanacaksanız o konuda sorun olmaz.
Siteden atılan toplu maillerde günlük 50 kişiden fazlasına gönderemiyorsunuz.
Dezavantajı yok ya da ben yıllardır karşılaşmadım hiç. Google'ın da benzer ücretli bir hizmeti var. Amaçları Yandex ile aynı, yani kurumsal yazışmalar için kullanılır bunlar. Kullanıcılar genelde e-posta abonelik bültenleri için kullanıyor ve hedefledikleri olmayınca Yandex'i kötülüyor.
Hatta sitenin SMTP ayarlarına kişisel gmail hesabını tanımlayanlar bile var.
EDIT: Unutmadan, Yandex kurallarına göre de çok yüksek olasılıkla spam gibi algılanacağı için, bu tarz bültenler için toplu e-posta göndermek yasaktır.