FAT16 (File Allocation Table 16: Dosya Yerleşim Tablosu 16) Microsoft tarafından işletim sistemleri içerisinde kullanılması amacıyla geliştirilmiş dosya sistemidir. Bir önceki sürümü olan FAT12 sürümüne oranla FAT16 dosya sistemi 16-bit Binary sistemi kullanmakta ve daha geniş bir depolama alanını desteklemektedir.
FAT16 Dosya sistemi Microsoft tarafından üretilen Windows 3.x işletim sistemlerinde ve Windows 95 işletim sistemi içerisinde kullanılmıştır. FAT16'nın geçerliliğini yitirmesiyle birlikte daha üst seviye işletim sistemlerinde kullanılması amacıyla FAT dosya sisteminin son sürümü olacak olan FAT32 geliştirilmiştir.